Согласно исследованию, их метод диагностики может повысить точность до 100%, в отличие от обычного анализа секвенирования, точность которого составляет около 30%. Эта работа опубликована в Acta Neuropathologica.
Эпилепсия – неврологическое заболевание, часто встречающееся у детей. Примерно у трети детей-пациентов диагностируется трудноизлечимая эпилепсия, несмотря на адекватное лечение противоэпилептическими препаратами.
Соматические мутации в генах пути mTOR, SLC35A2 и BRAF являются основными генетическими причинами трудноизлечимых эпилепсий. Клинические испытания ингибитора mTOR, направленного на фокальную кортикальную дисплазию типа II (FCDII), проводятся в больнице Северанс, их сотруднике в Сеуле, Корея.
Однако трудно обнаружить такие соматические мутации, вызывающие трудноизлечимую эпилепсию, поскольку их мутационная нагрузка составляет менее 5%, что аналогично уровню артефактов секвенирования. В клинической области это остается постоянной проблемой для генетической диагностики соматических мутаций при трудноизлечимой эпилепсии.
Команда профессора Чон Хо Ли из Высшей школы медицинских наук и инженерии проанализировала парные мозговые и периферические ткани у 232 трудноизлечимых пациентов с эпилепсией с различными патологиями головного мозга в больнице Северанс с помощью глубокого секвенирования и извлекла основные фокальные гены эпилепсии.
Они сузили целевые гены до восьми основных генов фокальной эпилепсии, исключив почти все ложноположительные вызовы с помощью глубокого целевого секвенирования. В результате усовершенствованный метод значительно повысил точность и позволил им обнаруживать низкоуровневые соматические мутации в непревзойденных образцах мозга с фиксированным парафином с формалином (FFPE), наиболее клинически значимых образцах.
Профессор Ли провел это исследование в сотрудничестве с профессорами Донг Сук Ким и Хун-Чул Канг из больницы Северанс Университета Йонсей.
Он сказал: «Этот продвинутый метод генетического анализа улучшит общий уход за пациентами, обеспечивая более всестороннее генетическое консультирование и информирование о решениях по альтернативным методам лечения."
Профессор Ли в течение десяти лет исследовал соматические мутации низкого уровня, возникающие в головном мозге. Он разрабатывает инновационные методы диагностики и лечения неизлечимых заболеваний головного мозга, включая трудноизлечимую эпилепсию и глиобластому, в технологическом стартапе под названием SoVarGen. «Все технологии, которые мы использовали в ходе исследования, были переданы компании. Это исследование дало нам очень хороший импульс для перехода к следующему этапу нашего стартапа », – отметил он.
Работа была поддержана грантами Фонда Сух Кёнбае, грантом Национального исследовательского фонда Кореи, финансируемым Министерством науки и ИКТ, корейским проектом исследований и разработок в области технологий здравоохранения Министерства здравоохранения и социального обеспечения и Нидерландской организацией исследований в области здравоохранения и здравоохранения. Разработка.