Чоудхури и аспирант и первый автор Мохаммед Шаабан определили первую структуру Arp2 / 3 с близким к атомному разрешению в его активном состоянии с помощью криоэлектронной микроскопии. В структуре показан комплекс в его активной форме, связанный с сигнальной молекулой. Он также показывает зародышевый актиновый филамент, таким образом обеспечивая структурный снимок глобальных и локальных конформационных изменений в комплексе Arp2 / 3, которые помогают выращивать новые актиновые филаменты в клетках.
«Получение макромолекулярной структуры активированного комплекса Arp2 / 3 было давней целью ученых», – говорит Чоудхури, старший автор и доцент кафедры биохимии и клеточной биологии Колледжа искусств и наук Университета Стоуни Брук. «Наша структура показывает уровень молекулярных деталей, которые показывают отдельные компоненты комплекса и то, как они расположены относительно друг друга в активном состоянии."
Наличие структуры Arp2 / 3 в активном состоянии поможет провести более детальное исследование комплекса. Чоудхури объясняет, что это чрезвычайно важно, потому что когда Arp2 / 3 не регулируется в биологическом состоянии, это связано с метастазированием рака, нейродегенерацией, бактериальными и вирусными инфекциями и проблемами заживления ран.
«Таким образом, эта структура не только позволяет нам заполнить пробел в знаниях в области биологии актиновых клеток, но и потенциально помогает понять основные причины ряда заболеваний с конечной целью разработки новых терапевтических средств», – подчеркивает Чоудхури.
Определение структуры Arp2 / 3 в активированном состоянии потребовало от исследователей использования технологий, доступных в Центре криоэлектронной микроскопии Университета Стони Брук, центре, поддерживаемом Национальными институтами здравоохранения (NIH), и возможностях высокопроизводительных вычислений в Отделе медицинских исследований. Информационные технологии.
Чоудхури также связан с Институтом инженерной медицины и Институтом химической биологии и открытия лекарств в Университете Стони Брук, а также является аффилированным ученым в Брукхейвенской национальной лаборатории. Исследование было проведено в сотрудничестве с Брэдом Ноленом из Университета Орегона и при частичной поддержке NIH и SUNY, Университет Стоуни-Брук.